スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別

1 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:29:23.69 ID:ObED7c7h0

スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 – PC Watch
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

2 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:29:43.35 ID:1BYF2Pol0
俺でもできるわ
3 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:30:35.78 ID:dJ8PLEjG0
日本すごい!
4 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:30:52.07 ID:ETXMLuBk0
10日もかかるの!?
21 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:35:35.00 ID:HIPec9Tm0
>>4
そりゃコロナウイルスの塩基配列(数兆桁)を1桁から順番に数兆桁を並び替えて
あらゆる薬のコード配分(これもまた数兆桁)もまた同じ操作をして合致するかどうかを適合率として計算していくんだから
1人の人間がやったら100年かかっても1種類もあげられないレベル
34 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:38:58.69 ID:SJAvZFlmM
>>21
エンベロープ上のタンパクの配列(~1 Mbp程度)しか使わないし、遺伝子治療薬以外の薬にコード配列なんてない
さらに言えば遺伝子治療薬のコード配列もせいぜい10 kbp程度の長さしかない
新薬開発エアプか?
38 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:40:29.76 ID:EVXhmgYU0
>>34

そんな簡単なら何で薬が未だに出来てないの?

50 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:43:39.32 ID:RASc0WZi0
>>38
やめたれw
51 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:43:50.23 ID:SJAvZFlmM
>>38
候補出して合成したら終わりとはいかないから
既存の薬品も10年以上、ものによっちゃ30年とかかけて作られてるけど、候補物質のスクリーニング期間は長くても3年程度
67 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:48:58.08 ID:SJAvZFlmM
>>34
付け足しだけど、そもそも数兆(数兆桁だと意味不明すぎる)の長さのゲノムなんて高等生物にも無い
SARSウイルスのゲノムは確か30 kbpくらい
92 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:55:06.28 ID:5skjcgCd0
>>67
人間で750メガバイトだからな
CD-Rにギリ焼ける
69 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:49:10.73 ID:7Rz4lPVga
>>34
例えば抗体医薬品の場合、自分自身の立体構造を計算して、ウィルスのどこに結合するか3次元的かつ化合物の官能基ごとに調べていかないといけないだろ。これが簡単にできるとはいかに?
78 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:50:49.24 ID:SJAvZFlmM
>>69
どこに「簡単にできる」なんて書いたよ?
ただ明らかにアホ丸出しの状態でマウント取りに行ってるのに突っ込み入れただけや
5 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:31:21.53 ID:mnE9Zhpa0
チョン発狂
6 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:31:24.24 ID:u5dOOb+kd
効くかどうかもわからん候補挙げるなら誰でも出来るだろ
16 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:34:38.73 ID:7Rz4lPVga
>>6
じゃあとりあえずおまえが100種類くらい候補物質あげてみろよ
7 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:31:34.96 ID:+DzuEMftK
富岳三十六系にゃ
8 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:31:54.42 ID:06DRpkoPa
幼稚園児でもできるのでは??
9 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:31:56.05 ID:mO2cHmnW0
スパコン必要か?
10 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:32:15.27 ID:yxgubvQ80
いきなり日本のスパコンが世界で1位取れると思えないんだけどなんかからくりがあんのかな
22 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:35:51.06 ID:K2Z/LSjVa
>>10
割とマジで蓮舫のおかげだとどっかで読んだ
26 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:37:16.56 ID:DxmkU8syM
>>22
結果論ではあるが蓮舫があそこで一石投じてなければ今頃予算ブクブクのゴミスパコン事業に成り下がってたと思う
59 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:45:50.49 ID:aV3FRTsH0
>>26
思考停止で1位目指すとか主張してたアホ供の目を覚まさせたのはあるね
75 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:50:07.42 ID:5skjcgCd0
>>26
結果論じゃねーよ
利権バカの目を覚ましたのはすごい功績
56 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:45:14.90 ID:50seFLULp
>>10
他がもっとすごいスパコンを開発中でランキング発表のタイミングが良かっただけ
68 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:48:59.20 ID:Im7JczgNd
>>56
この分野はず~っとそんな感じでしょ
12 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:33:32.44 ID:K2Z/LSjVa
やったー絞り込めてきたー!
13 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:33:44.96 ID:WnmyOSyB0
富岳「何言ってんだいドク、日本製は最高さ!」
14 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:34:06.94 ID:cYwotrmO0
一年半かかってたものが10日でできるようになって調整すれば2日間にまで縮められるってすごくね?
お前らちゃんと評価しろよ
—–
いままでの常識では、創薬は約10年の時間がかかり、コンピュータの役割は候補薬をフィルタリングすることに、1~2年をかけて貢献していた。だが、新型コロナウイルスは即応性が必要であり、それに対して成果をあげることができた。創薬研究の方法論としては活気的なものである」とコメントした。

 「GROMACSは、富岳用にはチューニングをしていない。だが、GENESISをチューニングした実績をもとにすれば、GROMACSもチューニングによって、5~10倍速くなることを見積もっている。今回は約2,000種類の評価に10日間かかったが、これが2日間で終わるようになる」とした。

15 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:34:37.76 ID:nByyUHVX0
多けりゃいいってもんでもないだろ
17 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:34:41.91 ID:qL5NCxHE0
俺にワンパンで壊されるクセによお
18 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:34:54.44 ID:Wc8T/Sqj0
20くらいまで選別しろよ
19 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:35:01.83 ID:SJAvZFlmM
1 st.スクリーニングで2000超ならまあ普通では?
でも従来のスパコンでも2-3週で出来てた気がする
20 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:35:26.64 ID:Vj9PE4bc0
これでプリコネやってもいい?
23 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:36:01.27 ID:zOcReTrD0
やっぱり話題性のあるテーマに使うの?
24 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:36:20.16 ID:6neJdKS/0
はえー・・これは本当にホルホルできそうなんよ
25 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:36:24.95 ID:SJAvZFlmM
だいぶ昔に立体の1 st.スクリーニングをオンラインゲームにして一般人にやらせようとしたプロジェクトがあってな…
27 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:37:30.66 ID:/CdgvylX0
二位と3倍差は糞でかいな
二位が一ヶ月かかるところを10日で終わるとかチーとやろ
29 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:37:36.92 ID:uGkPDT5f0
蓮舫さんに感謝
30 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:37:53.05 ID:sAQEkAJvd
じゃあスパコンでスパコン作ればいいじゃん
31 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:38:36.04 ID:TlgO3z9zd
はえー
と思ったら候補かよ
32 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:38:45.65 ID:O0zwaJjF0
でも俺が水ぶっかけようとしたら土下座して許し乞うんだろ?
何がスーパーだよ
33 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:38:51.10 ID:10dTS2J+0
流石だわ。俺でもできることを平然とやってのける
35 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:39:19.92 ID:EgJs0ZR30
SARS、MARSですらワクチンできてないのにさ
口ばっかだな
36 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:39:32.63 ID:dQVn6OIQ0
プログラムの最適化したIT奴隷が凄いという話?
37 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:40:25.51 ID:aPECG7J90
チョンモメン嫉妬しまくりで草
39 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:40:37.14 ID:WuqCdsbs0
時報はもうイヤだー
40 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:41:24.19 ID:qBBohFmk0
富岳「ア、アビガンで・・・(忖度)」
41 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:41:37.72 ID:r0zykJxT0
実際効くのかどうかやで
42 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:41:40.80 ID:k2hBcHF80
SARSですらワクチン無かったんだがどうなるやら
43 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:41:54.50 ID:p8OMwDwD0
お前らが考える選別 本棚の本をタイトルだけ見て、選別する
一般人が考える選別 本棚の本を隅から隅までとことん熟読して、選別する
44 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:41:54.70 ID:DxmkU8syM
スパコン最大の障害は人間
スパコンがいくら論理解をアウトプットしても人間が採用しなけりゃそれまで
「アビガンが入ってないじゃないか!やり直させろ!」
83 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:52:17.68 ID:5skjcgCd0
>>44
どうせこうなる
88 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:53:04.96 ID:qCzmcSey0
>>44
そういうこと
特に日本人は人災畑だから
93 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:55:32.73 ID:5skjcgCd0
>>88
人災の宝庫だよな
45 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:42:12.21 ID:wmC9x12Id
分散コンピューティングの方が上じゃなかったか
46 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:42:44.53 ID:r0zykJxT0
昔あったセチ@なんとかで特効薬見つけられたんけ?
47 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:42:59.76 ID:ABMtGJWV0
2000下手な鉄砲数打ちゃ当たる
48 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:43:05.47 ID:Tv2fbLgd0
10日も掛かっててわろたw
49 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:43:24.50 ID:Q6PZlbI0M
嫌儲に新薬開発の先生おるんやな
52 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:44:00.26 ID:SvgzxgUY0
ジャジャ麺!冷麺!南部煎餅!わんこそば!前沢牛!
53 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:44:28.81 ID:TjTcCn8u0
日本はこのコンピュータ信用してないんじゃなかった?
満員電車が危険って出たのに無視してるんでしょ?
54 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:44:34.28 ID:oIQZhWFWa
他のスパコンでも1700くらいはみつけそう(´・ω・`)
55 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:44:34.49 ID:HlvwUtfO0
日本国民はこれがうまく行ったら蓮舫に土下座して謝れよ糞メディアもちゃんと開発エピソード載せろよ
58 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:45:46.11 ID:hGcYhwQZ0
使い勝手がいいのがミソだな富嶽は
すぐにアメリカや中国に抜かれるだろうけど1位じゃなくても売れるスパコン
蓮舫がダメ出ししてなきゃ演算だけは速いが使い勝手の悪いスパコン作り続けただろうな
60 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:45:58.78 ID:Mh3tNGPz0
薬として使える化学物質の候補出しまくるシミュレーションて
分散コンピューティングの頃から普通によくやってたよね
61 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:46:04.78 ID:Z+HygtZ50
さすが猿が作ったこんぴゅーたーですわ
62 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:47:20.69 ID:C/3XgoAR0

薬剤師なら1分だろ
64 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:47:41.66 ID:86yTq1oS0
あり過ぎて絞りきれてなくて無能じゃん
76 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:50:29.64 ID:f0GarPA30
>>64 2000種の中から選定してるんじゃないの?
77 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:50:40.84 ID:qL5NCxHE0
>>64
選定した上で特に効きそうな薬を順位化してるって書いてあるじゃん
1番効きそうな薬は実際は効果が無かったアビガンの二の舞にならんように名前伏せてるけど
65 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:47:41.80 ID:UFw1OyuJ0
スパコンが10日で結果出せてもスパコン使う人間が数ヶ月もかけてたら意味無いよね
今まで何やってたんだ?
66 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:48:10.31 ID:I9uZtVLm0
てかいまさら感すごすぎ
70 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:49:30.85 ID:0msh8jy60
2位でも出来んだろ
11日くらいで。
71 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:49:37.01 ID:SvgzxgUY0
富岳「岩手名物食っとけばなんとかなるやろ」
72 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:49:44.89 ID:JWis28Sp0
蓮舫「2位じゃだめなんですか?」
→スパコン運営「(イラッ)じゃあもっと安くて1位の作るわ」
→結果1位に
73 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:49:48.27 ID:lpN93C8W0
蓮舫ってもしかして有能なのでは?
74 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:49:51.82 ID:qCzmcSey0
ってか選別って意味あるのか
79 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:50:57.50 ID:qCzmcSey0
スパコン作ってもWindows動かないから
80 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:51:04.27 ID:Px2TdHFp0
その中から4年かけて治験していくからな
ワクチン開発レースはとてつもなく長い
81 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:51:19.32 ID:XD1Q7z2IM
多すぎわロタ
下手な鉄砲数打ちゃ当たる作戦かよ www
82 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:51:31.47 ID:TjTcCn8u0
まだ2位じゃだめネタやってるやついるのかよ
全文読んだか?それでも変わらんなら国語力無さすぎ
読んでないなら一回読んでこいよ
どっか落ちてるだろうし
84 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:52:20.93 ID:SAZX660E0
多すぎだろ
全然絞れてねーじゃん
85 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:52:26.61 ID:SvgzxgUY0
富岳「東南海地震が起きる確率は50%です!」
86 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:52:34.21 ID:w/jQCkgGd
とみたけすげえ
87 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:52:34.99 ID:qCzmcSey0
スパコンってシュミレーションが速いだけだからな
そのパラメーターは人間が設定するわけで
結局は人間の判断で決まる
89 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:53:24.58 ID:0EJ/G95B0
ジャップのアビガンどうなったんだよ
90 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:54:00.85 ID:bW0Pz18A0
2000って逆に馬鹿だろ
91 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:54:19.35 ID:Q9ClUoz80
1種類に絞れ無能
94 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:55:34.33 ID:1Q4qgpjUK
机上の計算が得意なお前らみたいだな
95 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:56:05.24 ID:ntPm1MeH0
自分いきます
96 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:56:29.87 ID:xACvm3SEM
イベルメクチンが最強という結果は出とるんや
97 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 06:56:34.47 ID:Q/9sO8X+0
絞りきれてねぇ

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