【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別

1 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 21:50:34.92 ID:CAP_USER

理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

 奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

 さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

3 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 21:51:23.11 ID:cpKvbWaA
俺にも使わせてくれ
ソシャゲが快適にプレイできるか試したい
8 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:03:12.11 ID:7IYd1u14
>>3
意外と出来ないと思うぞ
41 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:25:32.34 ID:4mMaDjNE
>>3
富岳の計算能力は大体スマホ3000万台分
4 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 21:55:07.61 ID:/0qWIPOR
さすがARMの高性能CPUはすごいな
5 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 21:59:35.00 ID:Z2K7oqhZ
多けりゃいいってモンか?
11 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:05:39.98 ID:sDW1jynz
>>5
レンポーさんご苦労さん
2位じゃダメみたいですね
36 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:20:44.12 ID:zwj0mO+G
>>5
もうちょっと絞って欲しいよな
37 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:23:10.99 ID:Uz/qnD6W
>>36
絞ってるぞ
トップ10くらい以外はゴミみたいな効果しかなさそーって
グラフがあったしそれミロ
49 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:34:48.21 ID:JRgHFmVx
>>5
判定対象が数千種類あって、それを10日で処理したんだろ
なるべく多くを短時間で処理できた方がよかろうよ
6 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:00:31.25 ID:nFc+VITg
今は分子動力学計算でそんなことまで解るようになったんだな
7 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:03:02.54 ID:1AH0K0iO
ちなみに、富岳の最寄り駅は「京コンピュータ前駅」だぜ
京はもう無いけど、駅名を変えるにはスゲー金かかるから、当分このままらしい
9 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:04:54.71 ID:jORb0OlU
分子動力学計算はgrapeの方が計算速いはずだけど、ARMベースのほうがプログラム構築が汎用的で使いやすいのかな。
10 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:05:03.51 ID:Q5OMRiJV
登山漫画の最高峰
22 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:10:16.79 ID:FCdKzH+l
>>10
中島の新型超重爆撃機だぞ

朝鮮人w

12 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:06:37.45 ID:1g63xeLY
富嶽もARM系だってな!
13 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:07:21.15 ID:3RXWDITC
馬鹿パヨ早速歯軋りw
14 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:07:30.90 ID:SB6CTMjf
おれが死ぬ確率と死ぬXデーの予測してくれ
51 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:36:02.11 ID:85CYw3+B
>>14
ワイコンピュータの計算によると2120年7月1日の時点で生存確率0.001%や
15 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:08:04.15 ID:xWGlDrgE
富嶽で使われるARMは、AmazonのAWSにも使われているよ。
16 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:08:50.12 ID:svClXDTx
でも明日の天気すら当たらないんだろ。
アホみたいに被害も出てるし何の役にも立たない。
17 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:09:09.59 ID:t7vAEC5j
臨床試験もバーチャルでできないの?
18 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:09:14.35 ID:IAsaYLDT
新薬ができるのは早くて2,3年だろうね。
順調に行けば5年ってとこ
それまでは代用品でだな
19 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:09:18.75 ID:4gbHHukk
税金で飯食ってる世界中の二重国籍者の分析をお願いいたします
20 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:09:20.11 ID:1E8UAD1S
で、実際の医療現場で薬使えるようになるのはいつなんだい?
21 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:09:31.78 ID:ktPFsPJ+
x=rnd(0)
23 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:10:29.96 ID:QbtQfM3H
これも結局一年もするとアメリカに簡単に抜かれるだろう
GPGPUだとこの半分の予算で倍の性能になる
24 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:10:30.40 ID:EnnTwFM9
2000種類って多過ぎね?
25 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:11:34.21 ID:bS9f5ADD
>>1
富岳って対コロナ用に前倒しで実戦配備されたんだよな
ガンダムみたいだな ガンガレ!
32 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:15:01.64 ID:5WqN0ntI
>>25
富岳「待たせたな」
33 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:16:30.13 ID:bS9f5ADD
>>32
京が1年掛かる計算を数日でできるらしいからな
21年始動を1年近く前倒ししたとか浪漫すぎる
26 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:12:54.37 ID:/qi0ZBX3
これで新型コロナを作ればいいわけか
28 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:13:31.54 ID:v377R+CF
ガスター10で、乗り切るから余裕
29 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:14:22.26 ID:sb3G0B34
くそきな臭すぎてレンホー応援したくなるレベル
30 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:14:39.23 ID:hzuHVl89
ハゲ治療薬がやっと完成する?
31 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:14:44.29 ID:in4rXIyi
いや1種類を選別するならまだしも2000種ってどでもいいだろ
34 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:17:40.20 ID:EnnTwFM9
1種類でも年単位で試験するのに2000種類も試験してたら
いつ出来るのやら。

2位のスパコンで良いんじゃね?

35 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:19:44.82 ID:9i/mAyrD
公務員大量解雇時代到来消費税なくなるぞ
38 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:24:21.46 ID:TwvxQ4Q8
凄えな富嶽。この調子であと一カ月もすれば、
どんな薬でもコロナに効くことが判明するのでは?
39 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:24:31.55 ID:H0cRu6Fy
ウ●コを入れればウ●コが出てくる
それがデータサイエンス

そんな方法で今までどんだけ失敗してきたか
スパコンになっても手法が糞なら糞しか出ないね

40 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:25:01.23 ID:deOhSO6b
別に富岳じゃないとできないわけじゃないんじゃないの?
42 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:28:22.80 ID:Uz/qnD6W
>>40
i7のCPU一個でも可能だが何万年もかかるというわけ
43 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:29:02.34 ID:wR2xIpx9
自慢にはならない
44 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:30:02.54 ID:F6x0oXEo
仮想化して分散処理させた計算とどう違うの?
45 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:30:19.53 ID:ncbxTIVS
他国のスパコンだってその位やってるだろう

ぶっちぎりの1位でもないのに

47 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:32:28.55 ID:4mMaDjNE
>>45
今はぶっちぎりの一位
そして4種類のベンチマーク全てでの一位(4冠)は史上初
46 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:31:55.84 ID:3QG/wvVV
>>1
俺なら2000どころか、もっと挙げてみせるぜ
10倍くらいいけるな
50 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:36:01.50 ID:JRgHFmVx
>>46
そこから可能性ありと抽出されたのは数十種
48 名前:匿名のゴリラ 投稿日時:2020/07/06(月) 22:32:31.28 ID:N8Jd+OdJ
富岳チューニングするための丁度良いデータ取りになるからこいつじゃないと意味ないだろうし
ガンガン使って使い勝手上げてほしいものだね

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